江晓与莎丽再次踏上旅行的路上，而火箭队这边，坂木战败后便逃回了关都，在路上武藏小次郎喵喵从怀里拿出陨石的小碎块。
而喵喵藏在了背后，将这些拿了出来，交给了坂木，博士发现后便立刻拿进研究室内继续研究。
板木便离开合众地区返回关都的飞机上，在回到关都后便召开了会议，让三人组想干嘛就干嘛？
不用管他们便进入会议室，博士的研究得到了新的进展，坂木将这些在会议上公布，讨论新的行动方案。
小智回到了飞云，事后便开始挑战道馆，而江晓与沙丽在途中江晓看见了一只爆香猴与一只爆香猿。
江晓放出化石翼龙，因为现在的快龙已经成神，随便放出来太惹眼了，换成了gs球，放在小灵儿的空间。
化石翼龙很快击败了爆香猴与爆香猿，江晓收服爆香猴，将爆香猿留给了沙丽让她收服。
沙丽收服后便再一次出发，很快到达了目的地沙丽与江晓分别，而江晓看着莎莉进入城镇，江晓才转身离开。
江晓又开始疯狂锻炼的旅途了，现在的江晓独自一人，在江晓的锻炼中树林中那些野生的心蝙蝠，都被混混鳄单独虐了一遍。
江晓早已将手中的神奇宝贝更换成为那几只 混混鳄 炒炒猪 咕咕鸽 水水獭 藤藤蛇。
在锻炼中咕咕鸽进化了成为轰隆雉鸡，而水水獭也跟着进化了成为双刃丸，在这场战斗中哪些不足，江晓都会指点出来。
因此所有神奇宝贝进步都非常的大，没有进化的也学会了更多的绝招，而江晓再次出发。
几天后，在一片树林中江晓再次出现指挥着扒手猫与食梦梦对抗一群野生神奇宝贝，而就在这时混混鳄进化成为流氓鳄。
炒炒猪依然在不停的战斗终于也跟着进化了成为炎武王，车轮球也跟着进化成为蜈蚣王。
蜈蚣王还叼着一只神奇宝贝回来，江晓让他们四处战斗，将打晕的神奇宝贝全部带过来。
江晓单独给他们治疗，而后还有神奇宝贝食物，仔细一看蜈蚣王叼回来的神奇宝贝竟然是花椰猴。
江晓自然不会放过直接收服，食梦梦与扒手猫就是这样被收服的，在森林里无忧无虑的生活着，突然被攻击随后被收服。
所有神奇宝贝在被打败的那一刻，除非被他们叼在嘴上带回去，大部分都是帕路奇亚通过空间带回来的。
江晓收集了很多的草药，以及药品购买了大量的神奇宝贝食物，以及制作大量的能量方块。
在这庞大的资源下在这庞大的资源下，有些神奇宝贝在治疗后继续去挑战揍他的那只神奇宝贝。
而结果是再一次被打败，很快江晓让他们回来，再收回神奇宝贝球内后进入城镇后补给。
在更换神奇宝贝后江晓再次进入森林开始挑战，藤藤蛇终于进化了成为了青藤蛇，石居蟹进化成为岩殿居蟹。
滚滚蝙蝠找到一个很特别的地方，赶忙飞回来在江晓身边来回转悠，江晓召回所有神奇宝贝，来到了滚滚蝙蝠发现的地方，发现居然是一个遗迹山洞。
这遗迹山洞很大，突然有一只神奇宝贝突然攻击他，江晓看见居然是象征鸟，被江晓一巴掌拍的在原地转了两圈随后晕倒。
江晓直接收服，紧接着江晓发现一个小家伙在旁边隐藏但是你把自己隐藏了，面具至少也得藏起来吧。
如果不仔细看还根本看不出来，长的本来就黑，还躲在黑墙旁边，滚滚蝙蝠都看不下去了，过去直接打晕江晓直接扔出神奇宝贝球收服。