时光匆匆，三个月的时间很快就过去了。
三个月的时间里，玄天邪帝与南宫铁心带回了女娲星槎与前任天地盟主灭穹苍。
灭鬼神在得知自己父亲灭穹苍没死之后，一度怀疑人生，认为这一切都是谎言，意志也有些消沉。
而后宗主与灭鬼神在南宫世家之外的山林之中，打了一场，宗主将灭鬼神打醒，恢复过往信念，灭鬼神才振作起来。
随即，振作起来的灭鬼神与灭穹苍大战一场，以自身推陈出新的不灭金刚道将灭穹苍的赤盖四阳功彻底击破，将灭穹苍打败。
但这一战之中，灭穹苍催动全部功力的赤盖四阳功，导致自身心疾爆发，在败于灭鬼神后，便陷入了昏迷不醒的状态，灭鬼神见此，求助北冥雪，请其用神农尺为灭穹苍治疗。
但灭穹苍自身的心疾来自于其自创的赤盖四阳功，源于自身人体五行失衡，火行之力压过其他属性的力量，导致心脏太强，其他脏腑无法与心脏匹配，故北冥雪虽能以神农尺为其治愈好伤势，但是赤盖四阳功不废，心疾便会反反复复，一直留在灭穹苍体内，永远无法痊愈。
灭鬼神见此，请求灭穹苍将赤盖四阳功废掉，但灭穹苍却说什么都不肯废功，父子俩的关系陷入僵局。
灭鬼神也只好传书与自己的弟弟，如今江湖十大英杰之中的念苍生，说明来龙去脉，让念苍生来规劝灭穹苍。
念苍生接到传书后，便急忙赶来了南宫世家，灭鬼神与念苍生两兄弟一起劝说灭穹苍，但灭穹苍还是不为所动，我行我素。
见此灭鬼神只好求助轩龙凌绝顶，凌绝顶接到灭鬼神请求后，便答应下来，随即便将灭穹苍的赤盖四阳功废除，随后将一本功法给了灭穹苍。
让其修炼这天蚕九变，以此蜕变自身天赋资质，凌绝顶告诉灭穹苍待其天蚕九变修炼完成，经历六次结茧重生，便足够修炼上天下地至尊功，还不会有赤盖四阳功的缺陷。
灭穹苍被废功后，也将凌绝顶给他的天蚕九变拿来修炼，发现此功不弱于上天下地至尊功，还带有每次结茧重生之后，肉身元神返老还童的神奇作用，灭穹苍欣喜若狂，在之后的日子里，沉浸在天蚕九变的修炼之中。
而这段时间，西门孝与乐娃的感情也进步神速，两人以音乐结缘，神舞在旁助攻，很快西门孝便向乐娃求婚，征得乐娃同意后，与宗主武战魂，云天使昙神见面，两人见西门孝虽然样貌平凡，但其性格直爽，憨厚老实，也与乐娃两情相悦，便同意了两人之间的事情。
西门孝也与乐娃约定，待元祖天魔事情结束后，便带乐娃去神兵小将世界，见其父亲西门豪，两人在成亲不迟，乐娃也同意了西门孝的提议。
……
南宫世家大门口，一座女娲星槎悬浮在天空之中，随即南宫世家大门打开，凌绝顶坐在轮椅之上被东方雄推着。
而两人身后，则是玄天邪帝，南宫铁心，白发南宫问天，蓝发南宫问天，南宫问雅，南宫问菜，东方铁心，北冥雪，灵剑双子，宗主·武战魂，乐娃，西门孝，灭鬼神，灭穹苍，念苍生，武勇，玉法王以及一众神兵兽擎天兽，天晶兽，子剑兽，太虚兽，猛虎，小太虚，十方明亮，神农兽，惊邪，凤凰，神舞，炎兽雄狮和两只神兽玉灵龙。
随后，凌绝顶运使真元，将自己落入女娲星槎之上，其余人见状，也飞身跳上了女娲星槎，随即南宫铁心启动女娲星槎，赶赴位于涿鹿之地的蚩尤秘窟。
涿鹿之野，昔日轩辕黄帝与蚩尤决战之地。
轩辕黄帝手持太虚与蚩尤手中的虎魄魔刀大战，待战至最后，两人都精疲力尽之时，蚩尤手中虎魄魔刀战虎凶灵反噬蚩尤，使得蚩尤被轩辕黄帝以太虚之力，将蚩尤肉身毁灭，虎魄刀跌落万丈深渊，蚩尤身死败亡。
然而轩辕黄帝却不知道，蚩尤的身躯虽然被毁灭，但其却没有彻底死去。
蚩尤元神残魂未灭，潜入涿鹿之野的地底下，地底之下早已被蚩尤布下秘窟，等待未来的某个时机复活归来，再战天地。
蚩尤秘窟，是昔日蚩尤得遇伏羲大神所遗留在灭邪玄网之中的大智慧球，以大智慧球窥探未来天机，得知了自己将会败亡的信息，便在灭邪玄网核心位置，建造了秘窟，以防止自己真的败亡以后，有机会能重新复活。
至于灭邪玄网与大智慧球，则是昔日伏羲大神所设置。
过去伏羲大神修炼天罡气诀，神功大成，元神出窍，云游天外，遨游星海。
于天外星海，得遇元始天尊坐骑龙马，从龙马身上的河图洛书之中，悟出八卦至理，修成玄阴内丹，彻底将上天下地至尊功修至圆满，突破气关与神关，成就大神之境。
而后龙马邀请伏羲遨游天宫，但天规深严，凡人不得进入天宫。伏羲与龙马被守护天宫的众神所阻，双方大打出手，龙马四肢也惨被雷公电母以雷剪电叉打断。