经此一役，三地联盟虽暂退曹军，却也元气大伤，内部渐起波澜。
青州因全力支持西征，粮草辎重耗费甚巨，民生初现疲态，袁谭麾下部分将领心生不满，暗地抱怨联盟分配不均，出力最多却未得相应回报。江东之地，因山越虽未大规模侵扰，但小股骚扰不断，周瑜忙于应对，分身乏术，对联盟的后续支援也有所迟缓。
在雍凉，新附之众人心未稳，羌胡部落中一些强硬分子见联盟与曹操激战，损耗不小，对联盟的统治权威产生质疑，时有冲突发生。
诸葛亮深知攘外必先安内，遂决定暂放缓军事扩张步伐，全力整顿内部。他与庞统分赴各地，安抚人心。诸葛亮亲至青州，与袁谭会面，详细核算其出兵出粮明细，承诺战后必以肥沃之地、通商之利相酬，并助其在青州推行新的屯田之法，兴修水利，改善民生，以安其部众之心。
庞统则前往羌胡部落，凭借其博学多闻与辩才无碍，与各部首领深入交谈，讲述联盟之大义，剖析曹操之野心，许以牛羊、盐铁之利，并重申尊重其风俗与自治之权，逐渐平息了羌胡的躁动。
曹操退回许昌后，并未停止动作。他一边大肆宣扬三地联盟内部不和，煽动各方对其产生离心之意；一边积极筹备粮草军备，与西域诸国频繁往来，馈赠珍宝，许以重利，终使部分西域小国动摇，暗中答应为其提供良马、精铁等物资，更有甚者，允许曹军借道，以图从雍凉侧翼突袭。
与此同时，许昌城中暗流涌动。有一心腹密报曹操，言其阵营内部有细作与三地联盟互通消息，曹操大怒，责令荀彧彻查此事。荀彧领命后，明察暗访，却发现诸多线索皆指向一些平日里深得曹操信任的将领和谋士，一时陷入两难之境。若据实上报，恐引发内部哗变；若隐瞒不报，又怕曹操事后怪罪。权衡再三，荀彧决定私下约谈这些被怀疑之人，晓以利害，劝其迷途知返，暂不将此事告知曹操，以免自乱阵脚。
而三地联盟在诸葛亮与庞统的努力下，内部渐趋稳定。
为防曹操再次来袭，他们决定主动出击，但并非军事强攻，而是采取分化瓦解之策。诸葛亮修书一封，言辞恳切地送予荀彧，书中提及天下苍生之苦，汉室之衰微，暗喻曹操挟天子以令诸侯之行径乃逆道之举，劝荀彧审时度势，为天下计，勿助曹操为虐。荀彧得书后，心中久久不能平静，对曹操的忠诚亦产生了一丝裂痕。
另一方面，庞统则设计挑拨曹操与西域诸国的关系。他派人伪装成曹军使者，前往西域诸国，故意提出诸多苛刻无理的要求，令西域诸国对曹操心生不满。同时，又散布谣言，称曹操欲在借道之后，顺势吞并西域，使其陷入恐慌。
曹操闻知西域局势有变，急忙派遣使者前往解释澄清，却收效甚微。而此时，其内部细作之事也终被泄露，一时间，许昌城内人心惶惶，将领之间相互猜忌，军心动摇。
三地联盟抓住时机，关兴、张飞各领一军，对外宣称要直捣许昌，实则在边境陈兵威慑。曹操无奈之下，只得加强许昌周边防御，暂缓西进计划。但他不甘就此罢休，心生毒计，派人在三地联盟境内散布瘟疫谣言，引发百姓恐慌，扰乱民生。
联盟内部再次陷入困境，粮食价格因恐慌而飞涨，集市萧条，百姓纷纷闭门不出。诸葛亮立刻组织医者研制防疫之法，同时下令严查谣言源头，稳定物价，开仓放粮，救济百姓。庞统则领一支轻骑，在边境地区加强巡逻，防止曹军趁机偷袭。
在这场没有硝烟的战争中，三地联盟艰难应对，曹操亦未占到便宜。