医学交流盛会过后，济世堂的名声如日中天。前来求医问药、拜师学艺以及寻求合作的人络绎不绝。然而，树大招风，一场意想不到的风波正悄然袭来。
那是一个看似平常的清晨，叶尘像往常一样早早来到医馆，却发现门口聚集了一群人，吵吵嚷嚷，面露不满。叶尘心中诧异，走上前去询问：“诸位乡亲，这是怎么了？为何聚集在此？”
人群中一位老者站了出来，他气愤地说：“叶大夫，我们都是之前在济世堂看过病的人。你看，我这病吃了你们的药不仅没好，反而更加严重了。”说着，老者剧烈地咳嗽起来。
旁边一位年轻女子也哭诉着：“叶大夫，我脸上的红疹自从用了你们的药，变得更加红肿瘙痒了。济世堂一直号称医术精湛，可现在怎么这样啊？”
叶尘心中一惊，赶忙说道：“诸位，先莫要激动。让我为你们重新检查一下病症，这中间或许有什么误会。”
叶尘带着众人进入医馆，开始逐个为他们检查。在检查过程中，他发现这些人的症状确实有些蹊跷。按照以往的经验，那些药方应该是有效的，可为什么会出现病情加重的情况呢？
叶尘让学徒们把这些病人的药方拿来仔细查看，同时他也在思考着各种可能。这时候，小海突然说：“师父，我发现这些药方所用的药材，有些不是我们济世堂平时用的那种优质药材。会不会是药材出了问题？”
叶尘眉头紧锁，他来到药材储存室，对药材进行了仔细的检查。果然，他发现了一些端倪。有几味药材的品质与以往不同，像是被人掉包过。
叶尘意识到这是有人蓄意陷害济世堂。他对病人们说：“诸位，这是有人在暗中捣鬼。我济世堂行医多年，向来秉持着救人的宗旨，断不会用假药劣药来治病。我恳请大家给我一些时间，我定会查明真相，给大家一个交代。”
病人们看到叶尘认真诚恳的样子，情绪也稍微缓和了一些。他们表示愿意给叶尘一些时间来解决这个问题。
叶尘首先怀疑的是负责药材采购的环节。他找来负责采购的伙计询问：“小李，你最近采购药材的时候，有没有发现什么异常情况？”
小李一脸委屈地说：“叶大夫，我都是按照老规矩，从老供应商那里进的货啊。而且每次进货回来，我也都仔细核对过药材的品质，没有什么问题啊。”
叶尘觉得小李不像是在说谎，那问题到底出在哪里呢？他决定从医馆内部入手，秘密调查。
在调查过程中，阿芳发现了一个可疑的迹象。她对叶尘说：“师父，我发现最近有个陌生人总是在医馆周围转悠，而且他似乎对我们的药材储存室特别感兴趣。”
叶尘心中一动，他让阿芳继续留意这个人的动向。
几天后，阿芳跑来告诉叶尘：“师父，那个人今天趁着大家忙碌的时候，偷偷溜进了药材储存室。我已经让小海他们把他抓起来了。”
叶尘赶到后，看着眼前这个陌生的男子，问道：“你是谁？为什么要潜入我济世堂的药材储存室？”
男子一开始还嘴硬：“我只是路过，好奇进来看看而已。”
叶尘冷冷地说：“你莫要狡辩。这一切肯定是有人指使你这么做的。你若老实交代，我可以从轻发落，否则一旦报官，你就没有好果子吃了。”
男子听了叶尘的话，吓得脸色苍白，终于交代了实情。原来，他是被济世堂的一个竞争对手雇佣来的，目的就是在药材上做手脚，陷害济世堂，好让他们的医馆独占当地的医疗市场。
叶尘得知真相后，既气愤又无奈。他让人把这个男子送到官府处理，同时也在思考着如何挽回济世堂的声誉。
他决定亲自带着那些被误诊的病人重新诊治，并且免费为他们提供最好的药材和治疗。他还在医馆门口张贴告示，详细解释了济世堂被陷害的经过，并且向大家承诺，济世堂以后会加强管理，确保类似的事情不再发生。
经过一段时间的努力，病人们的病情逐渐好转，济世堂的声誉也慢慢恢复了过来。
然而，这场风波也让叶尘意识到，济世堂在管理上还有很多漏洞需要弥补。他开始重新规范医馆的各项管理制度，从药材采购、储存，到人员进出，都制定了更加严格的规定。
在规范管理的同时，济世堂也在探索新的医疗技术。叶尘听闻远方有一位擅长针灸麻醉的神医，他决定亲自去拜访学习。
叶尘带着小海踏上了求学之旅。经过长途跋涉，他们终于找到了这位神医的住所。