军机处是崇祯参照后世清朝的军机处所设立的。
军机处不是常设机构，而是个临时性机构，相当于我们后世政府经常设置的专班。
这里的所有人都是兼职，他们的升转仍在原衙门进行。军机处不设正式衙署，但是有值班房，在崇祯寝宫养心殿外，便于崇祯召见大臣议事。对于一些秘密或是紧急的军政大事，崇祯帝在此询问情况并听取军机大臣意见，然后做出裁决，军机大臣根据崇祯帝旨意，草拟文书。上谕形成后，不经过内阁，由军机处直接发给有关官员。
若说设立大都督府的主要目的在于集中军权，使军事指挥权力得以高度统一，那么设立军机处则是为了大力增强皇权，巧妙地削弱内阁的权力。
有了军机处的紧密配合与高效运作，崇祯便能在处理政务时绕过内阁，直接发布命令，从而在一定程度上实现架空内阁的意图，使得皇权得以更为直接且有效地掌控国家的军政大事。
章正宸等三人紧紧跟随在史可法的身后，踏入了皇宫的大门。
他们身为京官，虽说身处京城的权力核心圈，然而由于官职低微，此前竟从未有机会踏入皇宫这片神秘而威严的禁地。此刻，当他们初次踏入皇宫时，眼前所见却并非是想象中的金碧辉煌与庄严肃穆，而是一片满目疮痍的衰败景象。
皇宫中的大多数宫殿，历经了长达二百年的风雨侵蚀与蠹虫蛀蚀，早已失去了昔日的辉煌壮丽，多已坍塌废弃，断壁残垣随处可见。弘光帝登基之后，曾下令重修宫殿，试图恢复皇宫的昔日荣光，然而其在位时间不过短短两个月，在这短暂的时间内，大多数宫殿的重修工作才刚刚起步，便被崇祯果断叫停。
养心殿作为皇宫中至关重要的建筑之一，因其特殊的地位与用途，得到了相对较好的维护与修缮，故而保存尚算完整。
只是章正宸在行进途中敏锐地发现，皇宫之中随处可见执勤的亲卫，他们身着整齐的甲胄，手持兵器，神情严肃地坚守岗位，然而却不见宫女、太监的身影穿梭其中，整个皇宫显得格外冷清与寂静，与往昔那种宫女太监往来忙碌、热闹非凡的景象形成了鲜明而强烈的反差。
“如今这皇宫之内仅留必要之人，之前弘光朝的宫女、太监，绝大多数都已被遣送归家，”仿佛看穿了章正宸等人心中的疑惑，史可法主动开口解释道：“如今陪伴在陛下身边的，除了王大伴，便是韩赞周韩公公……”
崇祯作为从后世穿越而来的人，内心深处着实难以习惯有人整日围在身边伺候自己的生活模式。况且，在这国家动荡不安、局势危急的时刻，显然并非是享受安逸之时。
故而在这皇宫之内，崇祯秉持着精简人员的原则，除了那些必不可少之人，其余皆被他一一打发走。尤其是对于太监群体，他更是态度坚决，严令禁止再有自残身体以谋求进宫侍奉的情形出现，试图从根源上改变这种不良的宫廷风气与传统陋习。
对于崇祯帝的这些言行举止，章正宸等人心中不禁涌起一股深深的钦佩之情。他们未曾料到，这位崇祯皇帝经历京城之变后，其思想与行事风格竟会发生如此巨大而深刻的转变。由此可见，此次京城的变故对他的触动与影响实在是极为深刻，犹如一场灵魂深处的洗礼，促使他在治国理政方面有了全新的思考与变革举措，也让臣子们对这位皇帝有了全新的认识与期待。
待到众人来到军机处所在之处，却又不禁一愣。
军机处设立于养心殿外的一处偏殿之中，由于创设时间极为仓促，各项筹备工作难以周全完备，目前仅仅收拾出一个面积不大的房间，按照崇祯的特殊要求进行了简单的布置与陈设。而这种布置风格与这个时代传统的布局模式截然不同，充满了新奇与独特之感。
偏殿的最里面摆放着一处锦榻，这便是崇祯的座位。
锦榻的正对面，放置着一张宽两米、长六米的长桌，桌子的两侧整齐地摆放着太师椅。桌子上则陈列着笔墨纸砚等一应俱全的书写用品，这便是军机大臣们议事时所用的办公桌，简洁而实用，为大臣们提供了一个便于商讨军国大事的场所。
而在房间的角落里，又另行摆放了几张单独的桌椅，坐在此处的官员，其职责便相当于后世的秘书，主要负责详尽地记录会议内容，起草诏书等重要文件，确保每一项决策与政令都能准确无误地被记录与传达。
这种别具一格的摆设方式，主要是借鉴了后世的会议室布局理念，旨在为崇祯与军机处的人员营造一个更为高效、便捷的沟通环境，以便能够迅速而有效地解决各类军政难题。