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处理完左良玉的事，秦牧神色一整，接着说道：“杨慎，开始吧。”
杨慎起身向秦牧一揖，然后朗声说道：“如今天下战争频发，为了应对即将到来的更高强度的战争，大人拟在军方设立几个部门，分别是总参谋部，总监察部，总装备部，总后勤部。这几个部门将分管我军作战、政治、装备、和后勤等工作，直接向大人负责。
总参谋部将作为在秦大人的领导下，负责组织我军建设和作战指挥的最高军事统率机关。根据大人初步构想，总参谋总将设置以下有司，分别为：作战部，军情部，军训部，装备部，动员部，机要司，测绘司等部司，各司其职。”
三司厅的各人都凝神屏息听着，暂时没有人出声。
杨慎接着说道：“接下来要说的是总参之下各部门的职能，首先是作战部。作战部将作为总参部的核心部门，全军所有的军事命令都将通过作战部下达，是全军战时的总指挥部；军情部主要负责搜集、分析军政情报，其他部门的职能顾名思义相信大家也不难理解。”
“接下来要说的是总监察部，总监察部的职能是为夺取战争的胜利，保证军队的忠诚、以及大人的政策在军队中的贯彻落实，保证全军在思想上与大人保持高度一致，保证军队政治合格和战斗力的提高等。下辖组织部、宣传部、保卫部、联络部、军事检察院、军事法院等部门，将对千户所以上的驻军单位派出佥事，分管军中的政治工作。”
“第三是总后勤部，主要负责全军后勤组织指挥和勤务保障，下设财务部、军需部、军医部、军械部、车船部、物资部等部门，其他的大家大概好理解，在这里要着重说的是医疗部，军医部最要的职能是组织指挥医护人员，战时负责治疗病患，抢救伤员。”
“最后是总装备部，负责全军武器装备的研制、测试定型等工作。”
杨慎把几个部门的情况大至介绍一番后，秦牧严肃地说道：“好了，在坐的各位请畅所欲言，有什么建议及问题可直接提出。”
司马安一直皱着眉头，秦牧话声一落，他立即说道：“大人，历朝历代在统兵权和调兵权上，都会作出明确分割，分权于不同部门，这一点至关重要；
比如宋朝，统兵权掌握在三衙手上，三衙负责军队平日的驻防，训练等事宜。而调兵权掌握在枢密院手中，一切军队调动，作战事宜必须通过枢密院来进行；
再看大明，平日统兵权掌握在五军都督府，调兵权掌握在兵部。五军都督府平日掌兵，而无权调兵；兵部负责战时调遣军队、指挥作战，但平时无权掌兵；
从历朝历代的成例中，不难看出分割调兵权与统兵权的重要性，然而，大人设置的这个军制，属下看不出有对统兵权和调兵权的明确分割，这极为不妥。”
司马安的话可谓是直指核心要害，为了保证军队不出问题，防止将领权力过大，在军事体制方面，中国古代的体制甚至比后世的体制更完备，也更严厉。这种调兵权与统兵权的明确划分就是最好的说明。
拿宋朝的军制来说，平日统兵的将领，包括三衙的主官在内，若是没有枢密院的调令而擅自调动军队，轻者解职，重者处斩。
明朝也基本沿用了这种调兵权和统兵权的划分，而且更加严备，宋朝将全国的军队分统于三个衙门，而朱元璋则将全国军队分统于五个都督府，这样最高的统兵将领权力被划分得更小。
这种划分有效地防止了将领专权，威胁到皇帝统治地位。
秦牧当然知道划分统兵权和调兵权的重要性。
但是，他也知道正是由于这种划分，使将领受到了极大的牵制和约束，直接导致的结果是军事上的反应迟缓，突发战争时，往往十分被动，容易错过最佳的战机。
就目前而言，秦牧手下只有十五万军队，而且很快将面临一系列高强度的战争，若是现在就对将领过多的牵制，使军事体制过于硬化，对接下来的战争将极为不利。
正是考虑到这一点，秦牧在设置这套军事体制时，才对统兵权和调兵权的划分进行模糊处理。