之后是一段种田剧情，期间有各路大佬来求取灵植，苏知许也成了小有名气的灵植师。
正当她的种田事业蒸蒸日上，与圣子、鬼王纠缠不清时，得知了许家一夜之间被灭的噩耗，她赶往许家时只看到了遍地的废墟，现场一点痕迹都没有。
哪怕感情不深，也是她的家族，因此她也很积极地与因在慈悲林而唯一活着的许静檀一起调查原因，怀疑了与许大小姐比试过后又消失的陈惟，最后发现灭门的是早已在澜明界销声匿迹的魔族所为。
事情的起因竟然只是那早早暴毙的许五小姐曾得罪过他。
而那魔族早已经屠遍了东域仙门，留下令人闻风丧胆的传闻，撕开裂缝回去了。
没有魔族引路，除非成仙，否则去不了魔界。
因此这件事便不了了之，却也为女主和圣子念若生的关系更加暧昧。
这时她的好姐妹许静檀放弃了佛修，转修了剑道，在佛子的引荐下拜入了太一门掌门门下，想要等修为高了之后重建许家。
这时苏知许才知道她的好姐妹是慈悲林佛子的女儿。
一代渡劫期的佛子竟然有个女儿，苏知许还惊讶了一瞬。
还是念若生解释佛子修炼的是慈悲主的大轮回经，刚入渡劫时被邪修暗算，一无辜女修被牵扯进去，之后便有了许静檀。
佛子渡劫回去之后，慈悲林出动了十几位化神与五位渡劫，将西域一带的邪修清理地干干净净。
这一件事既没有被隐藏也没有刻意宣扬，慈悲林默认了许静檀的身份，但也只是允许她的存在，后来许家派人接走了尚在襁褓中的孩子，一直养在族中。
后面发现许静檀不亚于佛子的天赋，慈悲林的一些人又将她带了回去。
后面则是苏知许不停地被人瞧不起然后用灵植打脸，收服人心。甚至还成为了妖域尊敬的灵植师，每一只妖都臣服在她的灵植下。
《重生之农女种田飞升记》里最大的反派就是一个几千年前被慈悲主封印的大乘期邪修，后面又出来了。
女主为了打败他，各种努力修炼，用灵植提升己方实力，在一波又一波邪修的攻击下与男主死里逃生，感情慢慢变浓。
就在他俩挑明心意，准备不顾一切在一起，等此次事件尘埃落定就结为道侣时。慈悲主也出现了，而念若生却是慈悲主的一个分身。
他修炼的大轮回经，若要飞升则需要历经九次轮回，几千年前他以身镇压邪修头子时，轮回就开启了。
念若生是第九世，现在轮回圆满，他要飞升了。
飞升前慈悲主解决了邪修，成为了万年里第一个飞升的存在。
留下女主望着他最后看不懂的眼神暗自伤神，颓废了几百年，也不搭理系统，在鬼王锲而不舍的温暖下才重新开始修炼。
最终她拒绝了鬼王的求爱，决定跟鬼王做朋友，她要飞升去寻找自己的爱人。鬼王只能遗憾离场。
大结局是女主借助灵植的力量成功飞升，成为万年里第二个飞升的人，在仙界与等了她几百年的男主幸福在一起。