朱喜明和特区各部主官经过再三权衡之后，决定将他的两广特区首府设在广州城内。
因为在很长的一段时期内，广西的实际控制区域只能是在汉人相对集中的珠江平原一带。
而广东东部沿海物产丰富土地肥沃，水陆交通便利人口众多，才是他大展拳脚的风水宝地。
随后的一个月时间内广东和广西各师团都陆续传来了消息，基本上全是朱喜明和赵波所预测到的好消息。
随着消息而来的是和师团圆满完成作战任务后，新军各师团主将和各部骨干正前来广州城与他相聚。
朱喜明也令人制作了开府设衙所需要的大批官员印绶，印刷了几千张官员委任状。
他要按照四百年后的官僚体系，建设完善两广特区的旧官僚体系。
教育部部长杨子玉，农业部部长魏建平，商务部部长周天福，工业部部长宋应星，海务部部长吕烈。
文化部部长马飚，安全部部长赵波，卫生部部长吴又可，司法部部长兼两广特区大法官毛承斗。
交通部部长温朝刚，财政部部长毕矛康，统战部部长刘俊，两广特区首任行政长官为朱喜明。
他在两广特区首府设置十二个主管部门，下辖三十六个专职司署。
授予十二位部长三品官职印符，在两广特区境内设立管理分支机构，授予三十六位司长四至五品官职印符。
向两广特区各州府县衙官吏授予四至九品官职印符，全面完善旧官僚管理体制。
新军由四四制师团制编制改为三三制军团编制。
全面取消甲乙师团编制，改为由各军团根据武器装备和战斗力自行划分战斗序列。
第一军团司令杨贺，第二军团司令耿强，第三军团司令王新，第四军团司令魏建军，中央军团司令徐强。
亲卫营营长赵二宝，东海舰队司令奥罗拉，南海舰队司令卢塞洛，北海舰队司令安东尼。
新军总参谋部部长孙传庭，两广特区新军最高统帅朱喜明。
新军的总数量也将达到朱喜明所设想最高峰值的十三万人。
按照计划在这个编制基础上，新军以后只会在海军建设上增加兵力配额。
陆军只可以在现有十一万编制外组建各自的附属民团，用来协助新军维持地方安全稳定的任务。
根据这次在广东和广西两省的用兵情况，将在两广特区划分五个战区。
广西战区划给了魏建军的第四军团进行防守和布防。
广东战区划给了耿强的第二军团进行防守和布防。
广州战区划给了徐强的中央军团，只负责对朱喜明所处区域的防守和布防。
北部防御战区划给了杨贺的第一军团，主要是负责对福建、江西、湖广三省的外来防御。
西部防御战区划给了王新的第三军团，主要负责对贵州、云南两省的外来防御。
西和北两个防御战区如有敌军来袭时要求主动出击，在两广特区以外区域完成对敌的作战。
五个战区的作战任务下达和军团之间的配合，将全权交由新军总参谋部统一指挥。