海军是联邦最为重要的军事力量，虽然他们可能经常吃败仗，但也改不变不了他们为联邦做出的贡献。
通常情况下，舰队是由一艘艘战舰联合组成的。
由于舰队飞行员大多数为女性，机动步兵也喜欢称舰队为“舰队”。
每次联合行动，都需要机动步兵和舰队配合，进行作战。
在战舰上，或者在星舰基地内，免不了一些打架斗殴事件的发生。
海军经过百年的发展，已经分为了几大类。
【联邦直属舰队】：
通常情况下，这些战舰都会组成一支支舰队，遨游在联邦的各个星域，机动支援各地。
这些舰队会直接受到司令部指挥，指挥官也是一名领主上将。
通常情况下，旗舰会是一艘超主力舰，战巡、战列舰或者航母。
比较着名的舰队有联邦第一舰队、第五舰队、第十舰队等等。
这些舰队最强之处，就是拥有投放Q弹和其他灭绝武器的资格。
【星域直属舰队】：
星域直属舰队一般归属于星域总督指挥，用来机动支援星域各处。
司令部无法直接指挥这些舰队，当然必要情况下，可以直接越级指挥。
这些舰队的实力参差不齐，通常情况下都会由各个星域支付军费，招募的通常会是飞行员老兵。
其舰队整体战斗力，甚至略高于联邦直属舰队，这也是联邦各星球容易叛乱的因素之一。
【星系巡逻舰队】：
星系巡逻舰队的势力成分比较复杂，有联邦直属的，也有星域直属的。
但是最多的，还是星系总督直属的。
大多数舰队，用的都是二流战舰，实力参差不齐，只能勉强防御。
【行星探索舰队】：
联邦司令部直属舰队，通常战斗不会太强，但侦察能力强大。
配有联邦最先进的资源探索系统，无人机、雷达和工程机甲。
一般由一名海军校官负责指挥舰队，一名陆军校官负责护卫和侦察。
【星际战士联合舰队】：
强大的星际战士数量稀少，无法支持一支庞大舰队的运作。
这个时候，就需要凡人飞行员和机械师来帮忙，帮忙支持庞大的战争舰队运行。
星际战士听命于司令部调遣，但仅限于有紧急情况。
平时，他们会接一些星系总督或者星域总督派遣的任务，获取军费。
联邦的军费是不够用的，他们只能自己出去找活干。
【掠夺者部署舰队】：
体型庞大的掠夺者，无法在普通机库内被部署。
于是联邦重新设计了战舰机库，以便更快的把重型掠夺者部署到银河各处。
掠夺者计划的负责人是强尼里科，在强尼将军签字后，这些舰队才能从铸造星球装走掠夺者，带往战区。
【铸造之星计划】：
把一些拥有重要矿物资源的星球，改造为铸造星球，以便能更快捷的生产更多战争物资。
后面，把铸造星球划给追溯者一族，方便他们的生产和科研活动。
许多的战舰，也交由铸造星球生产，追溯者们也会帮忙改进战舰。
【联邦第一舰队司令】：卡门·伊班哪·C（上将）
【联邦第二舰队司令】：德朗·卡托（上将）
【联邦第四舰队司令】：李云龙（上将）
【联邦第五舰队司令】：叶卡琳娜·D·多滋（上将）
【联邦第七舰队司令】：何程峰龙（上将）
【联邦第十舰队司令】：村上牧野男（上将）
【联邦一零一舰队司令】：朴多仓（上将）
【联邦探索舰队指挥官】：多姆诺（上校）
【战争（掠夺者部署）第一舰队司令】：比利斯·巴巴尔（上将）
【战争（掠夺者部署）第二舰队司令】：贺楠（上将）
【战争（掠夺者部署）第四舰队司令】：卡德鲁·杰丝（上将）
【司令部舰队总指挥】：卡门·伊班哪·C（上将）
【司令部舰队总参谋长】：史坦纳·李·R·玛娜（上将）
【司令部舰队副总指挥】：马奎尔·G·德哈路亚（上将）
【司令部舰队副参谋】：李凯亚（上将）
【司令部舰队行动指挥】：王亚楠（上将）
【司令部舰队行动参谋】：胡列纳（中将）
【司令部舰队行动副指挥】：巴内尔·科多克洛索·J（中将）
【司令部舰队行动副参谋】：卡玛希·B·多特林（中将）
【司令部舰队近卫军团长】：史坦纳·Z·康佳德罗·祥（上将）