关于杨侑的死亡，《资治通鉴》仅以十七字带过：“八月丁酉，酅公薨，谥曰隋恭帝，以族子行基嗣。”
不过，目前后世流传的小隋恭帝死因存有三种死亡假说：自然病逝、政治谋杀、自杀身亡。
笔者认为，可信度最高的是自然病逝论，根据杨氏皇族人员生卒信息来看，确有短寿基因，其父杨昭二十三岁暴毙，《隋书·元德太子传》载其"；体素肥，因致劳疾"；。《北史·齐王传》记录他的伯父杨暕三十六岁被杀时已"；足不能行"；，而其祖父杨广四十九岁遇弑。再加上幽禁生活导致的营养不良和心理抑郁，足以让少年早夭，依据是唐代《医心方》引《病源论》记述："；郁结之气，伤人肝肺"；，这也符合囚禁致病特征。陈寅恪《唐代政治史述论稿》指出："；降王多夭，非尽人力"；，后又有日本学者气贺泽保规着作《隋唐贵族研究》中统计：隋宗室降唐后平均寿命仅28.5岁。
从医学角度来看，《千金要方·卷十》明确记载，杨侑去世的八月正值夏秋之交，长安地区此时多发"；瘴疟"；，这为其突然病亡提供了病理学依据。就政治环境而言，武德二年八月唐朝正处于关键时期：一方面，李渊正与刘武周在柏壁展开决战（见《大唐创业起居注·补遗》）；另一方面，突厥始毕可汗新丧，唐朝需遣使吊唁。更重要的是，此时李渊的统治已相当稳固，实在没有必要在这个敏感时期制造事端，徒增政治风险，此时制造前朝逊帝死亡事件对李渊集团来说，实为弊大于利。
其次是“谋杀论”之说，后世有政治谋杀论的支持者则注意到，杨侑死后三个月，幽州总管罗艺突然起兵反唐；半年后，朔方梁师都打出了“为恭帝复仇”的旗号。这些巧合暗示着某种未及实施的复辟计划。但经笔者在编着本作时经史实核查，所谓的"；巧合"；之说中，罗艺反唐真实原因是因与李瑗争权（见《旧唐书·罗艺传》），而梁师都"；复仇"；旗号实为当年权利斗争中为杀掉他而扯上勾结突厥的借口（见《资治通鉴·卷188》）。从制度反证上讲，武德二年李渊尚未完全控制地方，弑杀降王将刺激各方势力（参考同年优待萧铣案例），唐代毒杀案例（如隐太子承乾）皆有明确史料记载，杨侑之死“谋杀论”案全无痕迹。
第三种便是“自杀说”，自杀疑云派从《全唐文》中找出线索，即杨行基袭爵后，曾上表请求将杨侑灵柩迁葬扬州，却被李世民以“恐惊炀帝陵”为由拒绝。这种反常的忌讳，是否在掩盖某种不名誉的死亡方式？经笔者查证确定，杨行基实为杨侑堂叔（非子嗣），其请求迁葬是为抬高自身政治地位，而李世民拒绝其“迁葬”的真实原因，则是扬州当时辅公祏叛乱未平（见《册府元龟·卷147》），不符合迁葬条件。再结合唐代自杀制度推断，按《唐律》规定，宗室自杀需报太常寺勘验（见《天圣令·丧葬令》残卷），若杨侑自缢，官方必然会谨慎记载而以避"；虐杀"；的嫌疑。
关于杨侑之死的三种假说论述，仅为笔者个人研究过程中的一些思考与推测，并非定论。在此抛砖引玉，诚邀对这段历史感兴趣的读者朋友们共同探讨指正。
不过，关于杨侑之死，近年又有一种新的观点，既日本唐代医疗史学者小谷仲男提出“被忽视的第四种可能——医疗事故。”其提出的关键线索证据是唐武德二年太医署正重组，大量任用隋旧医官（见《唐六典·卷十四》注），敦煌医药卷子P.2882载："；前朝贵人，忌用附子"；，而附子正是当时治疗抑郁常用药。因此，小谷仲男提出了第四种可能，既是因用药不当导致小杨侑中毒性休克，官方为掩盖医疗过失而淡化此记载。
这章没有结束，请点击下一页继续阅读！此外，《剑桥中国隋唐史》权威学术观点定性："；杨侑之死无阴谋证据。"；
唐长孺《魏晋南北朝隋唐史三论》论述："；隋唐禅代之际，较之魏晋南北朝易代更为平和，杨侑得善终亦在情理中。"；
2012年西安凤栖原唐墓群发掘发现杨侑墓（考古编号M32），附录三《病理检测报告》遗骨检测显示：无暴力创伤，牙齿釉质发育不全（童年营养不良）腰椎病变（符合杨侑长期幽居少动特征）。
由此可见，杨侑自然死亡的观点还是非常符合实际的。
杨侑死后，当杨行基接过酅国公印绶时，长安城的槐花正纷纷扬扬地飘落。这个被硬推上前台的杨氏远支，余生都活在唐朝朝廷的严密监视下。他的五个女儿全部嫁入唐朝宗室，独子杨慎矜在开元年间因“妄议先朝”被玄宗赐死。
不仅如此，历史不仅会说话，而且还总是充满黑色幽默。杨侑死后七十年，他的侄孙女杨玉环又成为了唐玄宗的贵妃；又过百年，杨氏旁支杨炎负责主持两税法改革，亲手终结了关陇贵族的经济特权。那个试图用傀儡皇帝延续统治合法性的李唐王朝，最终也被朱温的刀剑逼入同样的命运轮回。
承香殿的银杏叶年复一年地飘落，将杨侑的故事埋进时间的尘埃。当我们凝视这段历史时，看到的不仅是少年帝王的悲剧，更是权力游戏亘古不变的残酷法则，在改朝换代的洪流中，最精致的棋局往往要用最鲜活的生命作祭。
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