成功封印“时空之门”后，联盟迎来了短暂的和平。艾莉丝和她的团队成为了英雄，受到了民众的敬仰和爱戴。联盟总部举行了盛大的庆祝仪式，表彰他们为守护宇宙和平做出的巨大贡献。然而，艾莉丝并没有被胜利的喜悦冲昏头脑，她深知宇宙广袤无垠，未知的危险随时可能再次降临。
在庆祝仪式结束后的第二天，艾莉丝便召集了科研团队和军事将领，召开了一场紧急会议。会议室内气氛凝重，艾莉丝站在巨大的星图前，神情严肃地说道：“虽然我们暂时粉碎了神秘势力的阴谋，但这只是一个开始。宇宙中还有许多未知的力量和潜在的威胁，我们必须保持警惕，做好应对一切的准备。”
科研团队的负责人大卫点了点头，说道：“指挥官，我们在对远古遗迹和神秘能量的后续研究中，发现了一些新的线索。这些线索表明，神秘势力背后可能还有更强大的势力在操控，他们的目标不仅仅是打开‘时空之门’，也许还有更深远的计划。”
军事将领卡尔皱着眉头，担忧地说：“如果真是这样，我们的处境依然十分危险。我们必须加强联盟的防御力量，扩充舰队规模，提高士兵的战斗素质。”
艾莉丝沉思片刻后，说道：“大家说得都对。我们一方面要继续深入研究远古文明留下的知识和技术，从中寻找应对未来危机的方法；另一方面，要加大对宇宙的探索力度，密切关注各个星系的动态，及时发现潜在的威胁。同时，卡尔，你负责制定一份详细的军事扩充计划，尽快提升联盟的军事实力。”
会议结束后，艾莉丝和大卫来到了科研室。科研室里摆满了各种先进的设备，科研人员们正在忙碌地工作着。大卫拿起一份研究报告，递给艾莉丝说：“指挥官，这是我们最新的研究成果。我们发现，远古文明在封印‘时空之门’时，留下了一种特殊的能量波动。这种波动虽然微弱，但却具有独特的频率。我们推测，通过追踪这种频率，或许能够找到远古文明的其他遗迹，获取更多的信息。”
艾莉丝接过报告，仔细地看了起来。过了一会儿，她抬起头说：“这是一个重要的发现。大卫，你立刻组织一支科研探索小队，带上最先进的探测设备，按照这个频率进行追踪。我会安排一支舰队为你们提供护航。”
与此同时，卡尔也在紧张地制定军事扩充计划。他与各个星球的军事指挥官进行了多次沟通，了解了他们的需求和建议。经过几天的努力，一份详细的军事扩充计划终于制定完成。计划中包括建造新型战舰、研发先进武器、招募和训练新兵等内容。
艾莉丝对这份计划表示了认可，并立即批准了实施。在接下来的几个月里，联盟各个星球都进入了紧张的建设和发展阶段。新型战舰的建造工作在各个造船厂有条不紊地进行着，科研人员们日夜奋战，研发出了一种新型的能量武器，这种武器具有强大的破坏力，能够对敌人造成巨大的威胁。
而艾莉丝带领的科研探索小队，也在宇宙中展开了漫长的探索之旅。他们沿着特殊能量波动的频率，穿越了一个又一个星系。在探索过程中，他们遭遇了各种危险和挑战。有一次，他们的舰队在经过一个黑洞附近时，突然受到了强大的引力干扰，战舰的引擎系统出现了故障。艾莉丝和船员们迅速展开抢修，经过几个小时的努力，终于成功修复了引擎，摆脱了黑洞的引力。
经过数月的艰苦探索，科研探索小队终于在一个偏远的星系中，发现了一座隐藏在星云深处的远古遗迹。这座遗迹与之前发现的遗迹有着相似的建筑风格，但规模更加庞大，结构也更加复杂。艾莉丝和队员们小心翼翼地进入了遗迹内部。
遗迹内部弥漫着一股神秘的气息，墙壁上刻满了各种奇异的符号和图案。科研人员们立刻使用设备对遗迹进行扫描和分析。随着研究的深入，他们发现这座遗迹中隐藏着一个巨大的秘密。原来，远古文明在封印“时空之门”后，预感到未来还会有更强大的敌人出现，于是他们在宇宙中建造了多个这样的遗迹，并在遗迹中留下了一种强大的防御武器的设计图和制造方法。
艾莉丝得知这个消息后，心中十分激动。她知道，这种防御武器对于联盟来说至关重要，如果能够成功制造出来，将大大提升联盟的防御能力。于是，她立刻命令科研人员将遗迹中的相关数据全部采集下来，并带回联盟总部进行研究和制造。
在返回联盟总部的途中，艾莉丝收到了卡尔的紧急通讯。卡尔的声音中充满了焦急：“指挥官，不好了！我们发现神秘势力并没有完全消失，他们在一个偏远的星球上重新集结，似乎在谋划着新的阴谋。而且，我们还探测到这个星球上出现了一股强大的能量波动，与我们之前研究的神秘能量十分相似。”