随着大顺军在山西、河南展开的大规模反击，清军开始将能打的不能打的部队都陆续调往那边，同时派人联络青海、甘肃一带与大顺军激战的回民，相约共灭李闯，牵制了大量顺军主力。农历七月，原本在济南一带徘徊的巴哈纳、石廷柱部清军三万余人西调进入怀庆府，与固山额真叶臣部的清军汇合。这部清军避开了大顺重兵集结的山西北部，丝毫不理在河北、山东西北部佯攻的大顺军偏师，从河南攻打泽州、潞安，意图由南向北直逼太原。
而到了农历八月下旬的时候，山西北部形势发生重大变化。驻守在保德、岢岚等地的顺军唐通部突然降清，攻击顺军在府谷的后营，顺军措手不及，损失惨重。唐通还与大同、宁武一带的清军互通声息，声势极震。
九月，之前曾经在大同城下铩羽而归的李过率军兵分两路再攻清军驻守的大同、宁武、保德一带，清代州三关总兵高勋连连告急，请求增兵添饷，并乞内庭之兵（八旗兵）尽速来援。这个月月底，南路的清军叶臣部在得到大量八旗军增援后，攻克了泽州、潞安，然后直抵太原城下。为了减轻太原大顺军的压力，山西南部、河南、河北等地的大顺军开始集结重兵袭击清军侧翼。与此同时，山西地方缙绅纷纷举兵叛乱，响应清军，顺军局面大坏。
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1644年10月15日，烟台港码头内，樯橹林立。十余艘在远东地面上难得一见的大船齐集于此，其中有七艘蒸汽机帆船、两艘商船、两艘武装运输舰、两艘护卫炮舰。在本月月初的时候，本土再度派来了两艘蒸汽机帆船，随船而来的还有陆军第105连、八旗新军第三营、部分补充兵（100名火枪手+50名炮手+200名八旗武士）、50名宪兵、350余名波兰雇佣兵、八匹安达卢西亚马以及大量武器弹药。
关于这个陆军第105连，是刚刚在南非成立没多久的部队。如今本土兵力实在紧张，暂时抽调不出足够的兵力赴远东，因此，军部便将南非的陆军第5连（原104连）一分为二。分别为第5连和第105连，然后补充了大量原河中保安团的士兵进去，以填补缺额。第105连成立后集训了不到两个月，便立刻登上了路过的运输船前往东方。该连连长李仁军中尉，穿越前是一名中学生，之前是陆军部的参谋，后来参加过几次国内的剿匪战，也在南非与科萨人战斗过一阵子，稍微历练出来后便担任了新组建的第105连连长。此外，孙胜军少尉担任了该连副连长。同时也来到了烟台。
他们以及新一批援军的到来。使得烟台堡的东岸军力大大增强。截止今天，计有陆军步兵870人、炮兵231人、八旗新军三个营2422人、挺身队12个中队3000人、353名波兰雇佣兵，总共6876人。此外，烟台堡内还有军夫队2500余人。黑水港内有新来的50名宪兵，大泊有230多名黑人士兵，鸳泊港还有40多名海军水手，再加上设立的三处派出所60多名巡警，总兵力还是相当可观的。
而烟台等地的人口在这个时候也达到了史无前例四万八千余人，如果加上东岸军队的话，那人数就直逼五万五千人了。这么多人是绝对养不活的！目前库页岛、烟台等地的粮食早就收获完毕，经过这些时间的消耗，大约还剩不到1800吨的样子。好在9月份的时候莫茗曾经率军到莱州、青州等地转了一圈。趁着春小麦收获向当地士绅们强行征集了一些粮草回来，使得存粮达到了约2300吨。此外，目前黑水港的冰窖内还有大约1400多吨大马哈鱼、1800多吨秋刀鱼、2400余吨远东拟沙丁鱼以及300多吨鲐鱼、鱿鱼、螃蟹、海参等杂货。不过今年的渔汛即将过去，目前还在海上飘着的4艘渔船恐怕接下来一段时间内的产量会相当有限，也就是说。东岸人将凭借现有的这么些粮食再撑到明年七八月间，而且还得留相当一部分种粮出来。
这粮食压力不是一般的大啊！预计缺口将在三千吨以上，这个亏空是无法弥补的。因为随着山东局势日渐混乱，目前整个山东的粮食产量从宏观上来看是在快速下降的，这意味着东岸人即便出去征粮征到的数量也将很有限。
说实话，当年顺军将地主土地分给百姓后山东的土地种植面积快速上升，如果能够坚持到秋收的话也许今年将是一个丰收年。无奈顺军败得太快，才两个月左右便在地主武装的反扑下不得不撤退。而很多分到了地主土地、正高高兴兴种地的百姓遭到地主武装驱逐甚至杀戮，很多人被迫逃亡，或者干脆当起了土匪，刚刚有些起色的生产秩序再次遭到破坏。
而顺军撤退后所造成的权力真空清廷未能迅速有效填补，目前山东各地烽火不断，到处是打着李闯旗号的土匪、山贼以及饥民起事义军，普通百姓根本无法安下心来种地，抛荒从贼者数不胜数。而且之前郭升在山东宣布免征三年钱粮，清廷招抚大员王鳌永、方大猷等人一开始为了争夺民心，也喊出了免征钱粮的口号。不过后来王、方二人发现这样下去不行，没钱征兵、养兵。