东厂机构精简，这有精简的好处，这个米柱现在要从上而下的全面改革，这也轻松容易得多。
这些事，这米柱可以做到一言而决。不像是锦衣卫，每一个实职千户之后，都有后台和靠山，宫里的，六部的、内阁的、或者是那些国公勋贵们，你想动一个人都不容易，更不用说是全换了。
在东厂内部，十二科主事以上，才是管理层，至于那些番子、役长们，只能算是普通的人员。
但你不要小看了这些普通人员，到了下面和地方，他们都是了不得的人物，在京城，他们还或许忌惮一下巡城御史和五城兵马司，在地方，根本无人能制。只是这十几年，万历在这方面卡得死死的，这个东厂没有敕命，是不允许离开京师的。
这些普通的人员，在各坊各胡同都是害群之马，他们养有大批打手，滋扰一方，这个常威就是凭着这些打手们，维持庞大的生意，还可以和锦衣卫抢地盘，抢收保护费。
这米柱第一道命令，就是将番子们调回来，统一的集训。第二道命令就是禁止役长、番子级征招任何的帮闲，任何一次行动，必须来总部报备，没有总部的令牌，不许行动。第三道命令，任何没有正式编制的人借东厂的牌子招摇撞骗，一律格子勿论。
这就限制了下面的人的权力，剥去他们的爪牙，将权力回收总部。
东厂和锦衣卫是大明在刑部、都察院、大理寺这三个司法机关以外设置的直接听命于皇帝，执掌“诏狱”的特务机构。
东厂权力在锦衣卫之上，只对皇帝负责，不经司法机关批准，可随意监督缉拿臣民。
起初，东厂只负责侦缉、抓人，并没有审讯犯人的权利，抓住的嫌疑犯要交给锦衣卫北镇抚司审理；但到了这万历年初，东厂也有了自己的监狱，他们的权力也就一发不可收拾了。
现在这米柱只是将常威随意下放的权力回收，掌握在高层手中。
这东厂目前最大的是米柱，掌刑千户，其次是理刑百户李铁，米柱将这掌班、领班、司房，这几级重新改组。
他们有掌班两个，贰副四人，米柱改为掌班三个，贰副九人，分成三班，每四个时辰一班，以确保这是可以十二个时辰连续工作，当班的掌班就是米柱和李铁不在之外的最高指挥官，谁值班谁就是老大，至于领班级则取消。
这司房则是改编总部，负责后勤、粮响、刑罚等。
接着是十二科，这是十二个小部门，各有各的负责业务，不像以前一样，由上官随意分派和抽签决定。
同时他也强化了这东厂的安保工作，一日三班都有人值守。
他这样一搞之后，有权带队出去执行任务的，只有十二科主事级及十二位掌班，司房则是总部，负责内务。
这下面的番役，共成立五个大队，每队百人，以前好叫法，叫大档头，相当于锦衣卫的百户，为彰显与锦衣卫的不同，才另改名称，现在米柱就让他们叫百户、总旗、小旗、校尉这四级。
米柱这是把业务更加的细致化，精简化。
以前东厂的任务范围，极广朝廷会审大案、锦衣卫北镇抚司拷问重犯，东厂都要派人听审；朝廷的各个衙门都有东厂人员坐班，监视官员们的一举一动，一些重要衙门的文件，如兵部的各种边报、塘报，东厂都要派人查看；普通百姓的日常生活，柴米油盐的价格，也在东厂的侦察范围之内，加上抓人审讯，他们可以忙死了，都忙不过来。
米柱首先砍掉了这百姓日常生活等业务，也不再向朝廷派出坐班。他将东厂的业务定义在，维护国家安全，维护皇家利益方面。
他依旧会派出密探，但是潜伏和秘密监视为主，至于监视的对象，他是订了甲乙丙丁四级，不再像以前那样，广撒网，闭着眼睛撒网出去。
而且米柱十分的清楚，那一些人该监视，那些人不应该监视，像这六部大臣、阁臣们，当然要留意他们们动向，至于其它的官员，不管也罢，岂不闻，秀才造反，三年不成，他们的重点，将转往各地的抚督、统兵大将、土司豪强，不法巨贾方面。
朱由校在登基之后，马上转入国葬模式，这庚辰宫变是结束的，这个李妃和卢受的人也被驱逐出宫，但这朱由校还是觉得这乾清宫死气太重，两个月内，有两位皇帝在此国葬，相当不吉利，不管群臣们怎么劝说，他都是坚决不肯搬回乾清宫，而是窝在潜邸文华殿里。
这个泰昌帝的灵柩停在乾清宫，这国葬也在此举行，这朱由校在乾清宫守灵，宫城的防卫由都督米礼义负责，他直接的将机动部队神机营，调入宫中戍卫，只不过这个朱由校就是缺乏安全感，就是不肯搬回乾清宫住。
这王安只好决定，先装修一新之后，再让这个皇帝还宫。